Pedagoginės psichologijos magistrantūros studijų programoje sukuriama dinamiška mokymosi aplinka, orientuota į psichologijos ir švietimo sąsajų supratimą, gilinamasi į sudėtingas pažintinių, emocinių ir socialinių procesų sąsajas, todėl studentai įgyja žinių ir įgūdžių, padedančių spręsti įvairias švietimo įstaigų problemas. Magistrantai yra rengiami moksliniam tiriamajam darbui bei savarankiškai profesinei veiklai, todėl įgyja pakankamai žinių ir įgūdžių mokslinio darbo planavimo, duomenų rinkimo, kokybinės ir kiekybinės analizės atlikimo, duomenų interpretavimo srityse, įvaldo psichologinio įvertinimo bei konsultavimo metodus, o taip pat išmokomi savarankiškai spręsti psichologines problemas, kylančias švietimo ar su juo susijusiose srityse.
Dauguma Pedagoginės psichologijos programą baigusių absolventų sėkmingai dirba psichologais, patarėjais, konsultantais ir tyrėjais, bendradarbiauja su pedagogais, administratoriais ir politikos formuotojais, kad sukurtų aplinką, kuri skatina optimalų mokymąsi ir raidą. Pedagoginės psichologijos magistro studijas baigę asmenys dirba psichologu ugdymo paslaugas teikiančiose organizacijose, pedagoginėse-psichologinėse tarnybose, vaikų ir šeimos konsultavimo centruose, vaiko teisių apsaugos tarnybose, socialinės paramos institucijose, profesinės karjeros centruose ir kitose tarnybose, kur dirbamas ugdomasis darbas.